巧克力囊肿疼痛的治疗方法主要取决于囊肿的大小和症状的严重程度。对于直径大于4cm的巧克力囊肿，手术治疗是首选，手术后可以辅助使用GnRHa和避孕药等药物来缓解疼痛和预防复发。对于直径小于4cm的巧克力囊肿，可以使用口服止疼药或GnRHa、孕激素、避孕药等药物来缓解疼痛，具体的治疗方案需要根据超声检查的结果来确定。

例如，一个30岁的女性患者出现了经期腹痛的症状，经过妇科超声检查发现她有一个直径为3.5cm的巧克力囊肿。医生建议她口服止疼药和GnRHa来缓解疼痛，并定期进行超声检查以监测囊肿的变化。经过几个月的治疗，患者的疼痛症状明显减轻，囊肿的大小也没有明显增大。

除了药物治疗外，患者还可以采取一些日常保养措施来减轻疼痛和预防复发。例如，保持良好的生活习惯，避免过度劳累和精神压力；注意饮食，多吃富含纤维素和维生素的食物，少吃辛辣和油腻的食物；定期进行妇科检查，及时发现和治疗任何异常情况。

总的来说，巧克力囊肿疼痛的治疗需要根据个体情况来定制，患者应该积极配合医生的治疗方案，并注意日常保养，以期达到最佳的治疗效果。