即使乳腺癌患者已经接受了手术切除，由于癌细胞可能已经转移到远处器官组织，仍然存在复发的风险。因此，许多乳腺癌患者需要在手术后进行化疗。化疗是通过全身应用抗癌药物来发挥作用的治疗方法。乳腺癌的分期越高，化疗的重要性就越大。即使在I期乳腺癌中，患者也可能从化疗中受益。对于一些早期分期的乳腺癌患者，虽然她们从化疗中获益可能较小，但也应该提供化疗的选择权，让她们根据自己的特殊情况考虑化疗的获益是否超过了其副作用。

化疗药物有很多种类，通常是联合使用的，通常在乳腺癌手术后3-6个月内进行。根据不同的化疗方案，通常每隔3-4周用药一次。最常用的两个化疗方案是AC方案（阿霉素和环磷酰胺）和CMF方案（环磷酰胺、甲氨蝶呤和氟尿嘧啶）。近年来，一些新的化疗药物，如紫杉醇类的化疗药物，也被广泛应用于临床，并取得了良好的疗效。不同的化疗方案有不同的优缺点，医生在化疗前需要与患者详细讨论，根据患者的特点制定个体化方案。例如，患者的一般健康状况、年龄、乳腺癌病理类型、分期、患者的愿望以及希望避免的副作用、甚至医疗保险和家庭经济状况等都需要在化疗前详细讨论研究。

一些乳腺癌复发的患者和有远处转移的IV期乳腺癌患者都需要化疗。并且，化疗方案和药物剂量需要不断调整直到取得良好的疗效。对于一些病灶较大的乳腺癌患者，为了解化疗方案的疗效或减小病灶降低临床分期等原因，需要在手术前进行化疗，这种方法称为新辅助化疗。

腺样囊性乳腺癌是一种特殊类型的浸润性乳腺癌，发病率较低，占全部乳腺癌的不到0.1%。临床表现为可切除乳房孤立肿块的这类乳腺癌患者一般术后预后良好。临床复发主要表现为局部复发，可以手术切除。远处转移以肺部多见，一般在原发乳腺癌病灶切除几年后发生。腺样囊性乳腺癌患者的原发病灶手术切除后，应密切随访—每年一次胸部X线拍片是必要的。如发现肺转移应及时进行化疗，后者也是唯一的有效治疗。包括卡铂、顺铂及足叶乙苷等化疗药物被进行了相关研究。由于腺样囊性乳腺癌发病率不高，针对其单一的试验很少。抗血管生成药物的试验多处于临床一期阶段，所以除非其他的经典化学治疗方案完全失败，一般不考虑抗血管生成药物治疗。

对于一些瘤体较大的乳腺癌患者，有时建议在手术切除肿瘤前进行化疗。通过术前化疗（也称为新辅助化疗）可以使肿瘤缩小，使手术容易进行，一些化疗前不适宜保乳手术的患者因肿瘤缩小而可以行保乳手术。此外，术前化疗可以观察化疗方案是否有效，为术后辅助化疗方案确定提供可靠依据。新辅助化疗目前应用非常普遍。

化疗对大多数浸润性乳腺癌是有效和必要的治疗。到目前化疗和内分泌治疗在防止浸润性乳腺癌复发上的地位是不可动摇的。手术后的放射治疗可以有效降低乳腺癌局部复发。对于一些特殊类型的乳腺癌，如炎性乳腺癌，化疗是非常重要的治疗方法。炎性乳腺癌通常先进行新辅助化疗，之后行改良根治术，术后行辅助化疗和放射治疗。化疗药物和其他乳腺癌的化疗相同。由于炎性乳腺癌是一种恶性程度很高的乳腺癌，大约1/3的患者在确诊前既已发生远处转移，因此需要积极治疗。