松果体区肿瘤的鉴别主要涉及到以下几种类型：生殖细胞瘤、畸胎瘤、松果体细胞瘤、胶质瘤（星胶、多形胶）和上皮样囊肿（胆脂瘤）。这些肿瘤在临床表现、影像学特征和治疗方法上存在差异。

生殖细胞瘤通常会引起邻近结构受压、颅内压增高以及内分泌症状。CT扫描显示肿块为等密度或稍高密度，内含高密度钙化斑；MRI显示肿块为圆形或蝴蝶状，T1等信号，T2高信号，增强后明显强化。生殖细胞瘤对放疗敏感，试验性放疗后病变可能缩小或消失。

畸胎瘤的头颅片常见肿瘤钙化斑，CT扫描多为囊性，示混杂密度，边缘清晰，瘤内高密度钙化斑和低密度囊腔，增强扫描肿块明显强化，而囊变区不强化。MRI显示肿块为混杂信号，脂肪为高信号，实质为等信号，牙齿和钙化为低信号。

松果体细胞瘤的临床表现因患者年龄而异，患儿不出现生殖细胞瘤的第二性征早熟，青、中年则表现性功能减退。CT显示肿块为均匀等密度或稍高密度，增强扫描强化程度不如生殖细胞瘤明显。

胶质瘤（星胶、多形胶）临床表现与生殖细胞瘤相似，肿瘤向四周组织浸润性生长。CT显示肿块为混杂密度，增强后明显强化。MRI显示肿块为T1低信号，T2高信号，瘤周有明显水肿带。

上皮样囊肿（胆脂瘤）的CT显示肿块为低密度，包膜有不全钙化和散在钙化斑。MRI显示肿块信号介于脑组织与脑脊液之间，T1低信号，T2高信号。