感染性心内膜炎的后遗症主要包括心力衰竭、心肌脓肿、心肌炎、急性肾衰竭等。1.心力衰竭：一般到后期瓣膜被破坏、并穿孔以及支持结构（乳头肌、腱索）受损后，会引起瓣膜功能不全或原有功能不全加重，进而诱发心力衰竭。2.心肌脓肿：感染性心内膜炎患者可能会有心肌脓肿的后遗症，可发生在心脏任何部位，以主动脉瓣环多见。3.心肌炎：主要是由于感染性心内膜炎累及心肌所致，所以会遗留心肌炎后遗症。4.急性肾衰竭：当患者合并有肾动脉栓塞时，很大程度会导致肾功能损害，严重会引起急性肾衰竭。对于感染性心内膜炎疾病，在发现后应尽早的配合医生治疗，不能延误病情，避免造成严重后果。