虽然精子的发生过程恢复，但是在数量和质量上可能有所改变。23%的男性发生斑状间质纤维化，虽然不影响输精管吻合后精子重现，但与不育有关。研究还发现，输精管结扎术后15%~40%的人输精管残端部位回产生精子肉芽肿；10%~50%的人可能发生附睾精子肉芽肿。

不过，大多数精子肉芽肿很小，无症状，临床检查不能触及。输精管绝育术后，50%~70%的男性可能出现循环抗精子抗体，在附睾内表现有对精子抗原的细胞介导免疫反应，不过实际的临床意义尚无结论。在远期影响的流行病学调查函中发现，输精管绝育术与心血管疾病、男性激素分泌（血睾酮、LH/FSH等）无明显的关联性。并且，与前列腺癌之间的关系目前尚无统一结论。比较明确的是，输精管结扎后男性发生泌尿生殖感染或炎症的风险较未结扎者高1.5~2.5倍。Tpis:对于有勃起功能障碍或其他性功能障碍病史的男性，应该慎重考虑该手术。因为该手术可能会激化你潜在的心理问题，让性功能问题更加严重。