恶性胸腺瘤与肺癌是两种常见的胸腺区肿瘤，它们在病因、临床表现、诊断方法等方面存在诸多差异。

首先，从病因上来讲，恶性胸腺瘤起源于胸腺上皮细胞，通常与胸腺的正常功能异常有关。而肺癌则与吸烟、环境污染等因素密切相关，属于呼吸系统恶性肿瘤。

在临床表现上，恶性胸腺瘤早期往往没有明显的症状，随着病情进展，患者可能会出现咳嗽、呼吸困难、胸闷、吞咽困难等症状。肺癌的临床表现则更为复杂，早期可能仅表现为胸痛、咳嗽、咳痰等轻微症状，晚期则可能出现呼吸困难、声音嘶哑、乏力、体重下降等症状。

诊断方面，恶性胸腺瘤和肺癌主要通过影像学检查进行诊断。恶性胸腺瘤常通过胸部CT、MRI等检查进行诊断，而肺癌则可以通过胸部X光片、CT、支气管镜等检查进行诊断。

治疗方面，恶性胸腺瘤和肺癌的治疗方法也存在差异。恶性胸腺瘤的治疗方法主要包括手术、放疗和化疗等，而肺癌的治疗方法则包括手术、放疗、化疗、靶向治疗、免疫治疗等。

此外，恶性胸腺瘤和肺癌的预后也存在差异。恶性胸腺瘤的预后相对较好，而肺癌的预后则与肿瘤的分期、部位、病理类型等因素密切相关。