当胚胎停止发育后，女性可以选择药物流产或人工流产两种方式来终止妊娠。如果孕囊较小，且妊娠时间在49天以内，可以考虑使用药物流产。药物流产的原理是通过服用药物使胚胎剥离，从而终止妊娠。然而，药物流产的缺点是出血时间较长，不全流产的风险较高。

对于孕囊较大的情况，建议选择人工流产。人工流产是通过手术将胚胎和胎盘从子宫内取出，从而终止妊娠。虽然人工流产的过程较为痛苦，但其优点是不全流产率较低，术后出血时间较短，并发症相对较少。

胚胎停止发育的原因有多种，其中染色体异常是主要原因之一。染色体异常可能来自父母任何一方，也可能由遗传因素引起。此外，孕妇患有内分泌系统疾病、感染病原微生物、受到有害环境因素的影响等，都可能导致胚胎停止发育。

为了预防胚胎停止发育，建议女性尽早怀孕，避免高龄生育。此外，戒除不良的生活习惯，如吸烟、酗酒、过度摄入咖啡因等，对预防胚胎停止发育也有积极作用。孕妇应保持良好的生活习惯，避免熬夜、情绪波动，并积极控制基础疾病，如糖尿病等。同时，避免接触毒物、放射线和化学物质，以确保胚胎的健康发育。

在怀孕期间，女性应定期进行产检，以便及时发现并处理潜在的问题。如果出现胚胎停止发育的症状，如阴道出血、腹痛等，应及时就医，以便获得专业的诊断和治疗。

对于患有胚胎停止发育的女性，医院妇科和生殖科是就诊的首选科室。在医生的建议下，患者可以选择合适的流产方式，并进行相应的治疗和康复。