新生儿肛门和直肠畸形是一种常见的先天性畸形，严重影响患儿的生长发育和生活质量。为了准确诊断和及时治疗，需要进行一系列检查。

一、常规检查

1. 尿液检查：通过尿液检查，可以判断是否存在直肠尿道瘘或直肠膀胱瘘。

2. 血象检查：血象检查可以帮助判断是否存在感染或贫血。

3. 血生化检查：血生化检查可以评估患者的电解质平衡和酸碱平衡。

4. 超声检查：超声波检查可以准确测量直肠盲端与肛门皮肤的距离，帮助判断畸形的类型。

5. CT扫描和磁共振成像：CT扫描和磁共振成像可以无创地显示直肠盲端的位置和骶骨发育情况。

二、造影检查

1. 尿道膀胱造影：通过尿道膀胱造影可以确定是否存在瘘管。

2. 瘘管造影：通过瘘管造影可以明确瘘管的形态和位置。

三、X线检查

1. X线腹部平片检查：通过X线腹部平片检查可以判断是否存在泌尿系瘘。

2. X线骨盆前后位片：通过X线骨盆前后位片可以评估骶骨发育情况。

3. X线倒置位摄片法检查：通过X线倒置位摄片法可以判断直肠末端气体阴影与会阴皮肤之间的距离，从而判断畸形的类型。

新生儿肛门和直肠畸形的诊断和治疗方案需要根据具体的畸形类型和患者的具体情况制定。早期诊断和及时治疗可以改善患儿的预后。