第一是病因治疗。针对病因治疗是最理想的治疗方法。去除致病因素有利于保护肾功。在尿路梗阻还没有引起严重的不可恢复的性功能损伤的时候，去除病因，有很好的治疗效果。

比如泌尿系统结核的患者，早期主要是抗结核药物治疗为主。当肾脏出现纤维化，有狭窄形成，对药物治疗没有反应时，再考虑手术治疗。

所有原发于输尿管的肿瘤，几乎都会出现尿路梗阻导致肾积水。这种主要是以手术治疗为主。最经典的手术方法是根治性肾输尿管切除和输尿管口两厘米膀胱袖形切除。对于孤立肾，双侧肿瘤，肾功能明显受损的，可以考虑姑息性手术。

泌尿系统结石导致的肾积水，一般结石小于0.6厘米的话，都能够通过输尿管尿道排出。临床可以通过大量饮水，跳跃运动，应用中药金钱草，海金沙，鸡内金，石伟，车前子等药物治疗，配合针灸肾腧，膀胱腧，三阴交，阿是穴等穴位能够促进结石排出。结石排出之后，肾积水能够自行解除。

孕期导致的肾积水，治疗是以疏通尿道，抗感染为主，应避免使用对胎儿有影响的药物和检查方法。

第2个是肾造瘘术。在病因不能解除，或者是患者病情危急的时候，可以行肾造瘘术，将尿液先行引出，解除肾积水。对于不能解除病因的，肾造瘘术可以作为永久性的治疗方法。

第三是肾切除。对于积水严重，肾功能损伤严重，合并有肾积脓时，可以行肾切除。