轻微患者去除诱发疾病的药物后只需要支持治疗。

中等严重程度的患者需要积极纠正心肺异常及热量异常，使用 5HT2A 拮抗剂。

高热患者（≥41.1℃）是病情严重的患者，应该接受上述各种治疗，并加用快速镇静，神经肌肉麻痹，和经口气管插管。

无论 5-HTS 的严重程度如何，用苯二氮卓类药物控制躁动是治疗该综合征的必要措施。

束缚身体是不可取的，这样做可通过增强与严重乳酸中毒和高热相关的肌肉收缩而增加病死率。

单氨氧化酶抑制剂（MAOI）所致低血压可用小剂量交感胺类如：去甲肾上腺素，去氧肾上腺素，肾上腺素升高血压。

高血压和心动过速可服用硝普钠，艾司洛尔等药物对症处理。

控制高热需减少肌肉过多的活动。对中度患者而言苯二氮卓类药物有效，在重度患者，体温常超过 41.1℃，应该立即气管插管，维持通气，并给予肌松药，如维库溴铵。