检测的不是主要致敏组分：过敏原的组成成分十分复杂，每种过敏原的主要抗原均不止一种。例如花生，有 Ara h1，Ara h2，Ara h3 等数种抗原组分。由于过敏原体外检测试剂的生产和抗原包被目前尚没有国际统一标准，各厂家包被的抗原组分不同，有可能对患者致敏的组分没有包被在过敏原提取物中，这时检测结果为阴性。

血清过敏原特异性 IgE 阳性结果与临床不符的可能原因：阳性结果只说明致敏：血清过敏原特异性 IgE 检测阳性只说明患者对该过敏原已经致敏，而致敏是否会出现临床症状，即是否表现出过敏反应还与患者的免疫状态、是否合并其他疾病以及是否应用影响免疫功能的药物有关。免疫功能平衡的致敏者可以不发病，有些患者可能多年过敏原检测阳性但没有临床症状。