1.体格检查：为临床上最常见的常规检查，通过体格检查可初步观察患者全身状况，常作为辅助诊断方法，体格检查常发现患者各生长发育指标低于正常同龄儿、上腹部隆起明显，可见胃肠蠕动波，结合其他辅助检查可帮助诊断。
2.实验室检查:
（1）血常规检查：最常用的临床辅助检查，观察患者有无合并感染、贫血等情况，患者血常规白细胞及粒细胞比值升高提示有感染，如血红蛋白下降提示贫血。
（2）电解质检查：目的是评估患者是否并发水电解质紊乱，电解质检查见钾、钠、镁等体内电解质异常，提示患者并发水电解质紊乱。
3.影像学检查:
（1）腹部X线及上消化道钡剂造影检查：主要用于快速诊断胃内是否存在隔膜以及隔膜部位、缺损程度，帮助诊断本病，患者服用钡剂后在X线观察下显影，检查可见胃大小形态正常，但在胃内幽门及其周围出现狭窄缺陷，则可确诊本病。
（2）心电图检查：目的是评估心功能情况，判断是否可耐受麻醉及手术，心电图检查大致正常的情况下可进行手术或无痛性胃镜检查。
（3）胃镜检查：可通过观察隔膜的具体部位，诊断本病。通过胃镜检查可见胃内存在隔膜可确诊本病。
（4）剖腹探查：对于较难诊断，且症状反复发作的患者，常通过剖腹探查方可确诊，探查可直观的见胃内有异常的隔膜存在，即可确诊。