着色性真菌病的发病原因是人体在外伤和各种免疫力低下前提下被真菌感染引起。因此其病因包括真菌感染、免疫力低下、外伤。
1.真菌感染：如裴氏着色霉、紧密着色霉、疣状瓶霉等可致病。
2.免疫力低下：免疫力低下使得机体难以抵抗外来真菌的感染侵袭。
3.外伤：绝大多数着色芽生菌病患者有外伤史，外伤使得各种真菌有侵入患者机体的机会，是造成着色真菌病的主要病因。