疱疹性咽峡炎和手足口病在多个方面存在区别：
1. 病原体：
- 疱疹性咽峡炎：主要由柯萨奇病毒A组中的部分亚型引起，如柯萨奇病毒A10型、16型、22型等，也可由其他肠道病毒引起。
- 手足口病：最常见的病原体是柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型，其中肠道病毒71型容易引起重症手足口病。
2. 传播途径：
- 两者较为相似，都可通过飞沫传播、接触传播。但手足口病还可通过污染物传播，比如接触被病毒污染的手、毛巾、手绢、水杯、碗筷、奶具、玩具、门把手、桌椅表面等被传染。
3. 发病人群：
- 疱疹性咽峡炎：多见于婴幼儿和儿童，成人也可发病，但相对较少。
- 手足口病：主要发生在10岁以下的儿童，尤其是3岁以下的幼儿更为常见。
4. 发病部位：
- 疱疹性咽峡炎：主要病变部位在口腔黏膜，疱疹和溃疡通常出现在咽峡部位，如咽后壁、扁桃体附近等，有时也可能出现在舌部，但一般不会出现在手足、臀部等部位。
- 手足口病：除了口腔黏膜有疱疹或溃疡外，手部、足部、臀部等身体部位也可能出现米粒大小的疱疹，部分患儿躯干等部位也可能出现皮疹。
5. 症状表现：
- 发热：
- 疱疹性咽峡炎：通常会突然出现高热，体温可达39℃-41℃，发热一般会持续2-4天。
- 手足口病：多数患儿也会发热，但部分患儿可能为低热，发热程度和持续时间因个体差异有所不同。
- 口腔症状：
- 疱疹性咽峡炎：咽痛明显，患儿吞咽时疼痛加剧，严重时可能影响进食。
口腔内的疱疹起初为充血性红点，之后发展为小泡，破溃后形成溃疡。
- 手足口病：口腔黏膜的疱疹或溃疡疼痛相对较轻，有些患儿可能因年龄小表述不清，仅表现为流口水、拒食等。
- 其他症状：
- 疱疹性咽峡炎：部分患儿可能伴有呕吐、腹泻、腹痛、肌肉酸痛等症状，但一般没有神经系统症状。
- 手足口病：部分患儿除了发热和皮疹外，还可能伴有咳嗽、流涕、食欲不振、恶心、呕吐和头疼等症状，重症患儿可能会出现神经系统症状，如嗜睡、精神差、头痛、呕吐、肢体抖动、站立不稳或肌阵挛等。
6. 并发症：
- 疱疹性咽峡炎：多数无严重并发症，预后良好，一般可在1周左右自愈。但个别患儿可能会合并腮腺炎等疾病。
- 手足口病：可能会引起脑炎、心肌炎、肺炎等严重并发症，尤其是肠道病毒71型感染的患儿，重症病例病情进展迅速，可危及生命。
7. 治疗方法：
- 两者目前都没有特效药物，主要是进行对症治疗。比如发热时给予退烧药或物理降温；
口腔疼痛使用一些缓解疼痛的药物等。同时，要注意补充水分和营养，保持口腔清洁。
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