首先，需要明确的是，阿片类止痛药物是管控药品，必须在医院内购买，并且需要办理麻醉药品知情同意书。对于脊索瘤术后的疼痛管理，阿片类药物可能是更好的选择，因为它们的不良反应相对较轻。

曲马多是精神管理类药物，同样需要在医院内购买，但不需要办理麻醉药品知情同意书。然而，根据您父亲的情况，阿片类止痛药可能更适合。

长期使用止痛药物时，阿片类药物的不良反应相对较轻。当然，具体的用药方案还需要根据您父亲的具体情况来确定。

需要携带患者身份证、户口本、诊断证明，以及取药人的身份证和两者的关系证明。如果两个人在同一个户口本上，户口本就可以作为关系证明；如果不在，可以由村里和街道来出具证明。去大医院的话，药品规格会更全一些。挂号去肿瘤内科或原来的就诊科室都可以办理。