你好，了解到你的情况。发现溶血性葡萄球菌还未清除，需要继续治疗。之前服用呋喃妥因多久了？

三周的疗程确实不短，但具体治疗时间还需根据病情而定。建议咨询医生是否调整用法用量。同时，确保肝肾功正常，因为药物可能通过肝肾代谢。

长时间服用同一种药物可能不利于恢复，建议咨询医生是否需要调整治疗方案。同时，注意多饮水，充分冲刷泌尿道有助于恢复。