奥司他韦胶囊可以用于治疗病毒性肺炎，但需要注意的是，它主要是抑制病毒复制的药物。对于咳嗽气喘和鼻涕等症状，建议您使用治疗这些症状的药物。同时，考虑到患者有双肾囊肿，在用药过程中要密切关注肾功能。

一般来说，奥司他韦胶囊的用法是每次一粒，一天两次。请确保按照医嘱正确使用。

是的，以上症状都需要关注。发烧可能是体内炎症反应的表现，咳嗽完呼吸不畅可能是肺部感染引起的。建议您及时就医，进行详细检查和治疗。