化脓性脑膜炎是一种严重的细菌感染，需要长期的抗生素治疗。虽然你的孩子的体温和囟门已经恢复正常，但脑脊液的指标仍然不正常，说明感染还没有完全清除。通常情况下，化脓性脑膜炎的治疗周期为两到三周，直到脑脊液指标恢复正常。

白细胞和C反应蛋白的正常只能说明炎症反应已经控制，但不能代表感染已经完全清除。化脓性脑膜炎的治疗需要根据脑脊液的指标来判断，直到指标恢复正常为止。否则，可能会留下后遗症。

头孢曲松是一种广谱抗生素，通常用于治疗化脓性脑膜炎。但如果效果不佳，可以考虑换用其他抗生素，例如万古霉素。然而，在更换抗生素之前，需要排除药物过敏史、肝肾功能损伤等慢性病史，以及蚕豆、心脏病史等因素。

万古霉素的用法和用量需要根据孩子的具体情况和医生的建议来确定。一般来说，万古霉素需要静脉注射，每天分次给药，疗程通常为两到三周。请注意，任何药物的使用都需要在医生的指导下进行。