您停经29天，受孕时间比较短，目前有腹痛和少量阴道褐色分泌物的症状。这种情况有两个可能：一是早期流产，二是宫外孕。为了确诊，建议您去医院检查血HCG和B超。

建议您尽快去医院检查，以明确病情。在等待检查结果期间，请注意观察症状变化，如有任何不适，及时就医。如果是早期流产或宫外孕，需按照医生建议进行治疗和休息。目前不要随意用药，等待检查结果出来后再做进一步处理。