首先，需要确认是否有肾虚的情况。长期腹泻可能会影响肾脏功能。同时，益生菌一般不会引起腰痛。建议您就医检查肾功能。

如果确诊没有肾虚，可能是由于长期腹泻导致的营养不良。可以考虑服用一些益气养血的中成药，如八珍汤或归脾丸等，帮助改善体质。但请注意，不要长期服用，1-3个月即可。

如果是益生菌类的药物，通常不会影响腰痛和乏力。但是，还是建议先治疗腹泻的症状，腹泻期间不宜服用补品。

平时应注意清淡饮食，荤素搭配，多喝温白开水，避免辛辣、生冷、油腻食物。合理运动，保持充足睡眠和愉快心情。这些都有助于改善身体状况。