妥布霉素眼膏的常见不良反应包括眼局部的毒副作用和过敏反应，如眼睑发痒和红肿、结膜红斑，发生率低于3%。

在使用妥布霉素眼膏之前，需要排除过敏及用药禁忌。哺乳期妇女使用妥布霉素眼膏时，应注意监测血清中总的药物浓度，避免与其他氨基糖甙类抗生素全身联合用药。

使用妥布霉素眼膏时，应遵循医嘱，避免长时间使用。同时，保持眼部清洁，避免交叉感染。