合生元益生菌是食品级的，主要用于日常调理肠道，不能替代药物治疗。对于宝宝的肠道问题，布拉氏酵母菌散是正确的选择。

建议等宝宝完全康复后再考虑使用合生元益生菌进行日常调理。这样可以避免干扰宝宝的恢复过程。

布拉氏酵母菌散是药用益生菌，针对性强，适合治疗肠道疾病；而合生元益生菌是食品级的，主要用于日常保健和预防。选择时应根据宝宝的具体情况和医生的建议。