您好，首先需要了解的是，氨基葡萄糖胶囊主要用于关节炎的辅助治疗和软骨保护。

这两种药物的主要区别在于结合的盐酸根和硫酸根。硫酸氨基葡萄糖可以参与人体中软骨基质合成，而盐酸氨基葡萄糖则不参与，并且可能加重肾脏的代谢负担。因此，硫酸氨基葡萄糖通常被认为是更好的选择。

盐酸氨基葡萄糖的服用人群中，可能会出现胃肠道反应。但是，硫酸氨基葡萄糖则没有这种副作用。

在使用任何药物之前，请务必详细阅读说明书，排除过敏及用药禁忌后遵医嘱。如有任何不适，应及时就诊。