是的，扁平疣可以使用五妙水仙膏进行治疗。首先，清洁病灶表面；然后，搅匀药膏并点涂于病灶上，等待7-9分钟药膏干燥；最后，擦去药膏并重复上述步骤。一般情况下，使用两次即可。请注意，若出现皮肤破损、棕褐色病灶或周围潮红水肿等情况，应立即停止用药。

在使用五妙水仙膏之前，请确保您没有对该药物过敏，并且没有其他用药禁忌。同时，使用药物时请遵循说明书的指示，避免与香皂、洗面奶等清洁产品同时使用。如有不适，应及时就医。