根据您的描述，宝宝可能患有小儿急性肠炎。衣芽孢杆菌活菌胶囊是一种有效的治疗方法，尤其针对腹泻。服用时可以打开胶囊，将药粉加入少量温开水或奶液混合后服用。请注意，服用前详细阅读说明书，排除过敏及用药禁忌后遵医嘱。用药期间如有任何不适，及时线下就诊。

此外，建议注意腹部的保暖，防止着凉。同时，继续观察宝宝的排便情况和体温变化。如有需要，及时就医。