您好，盐酸氨基葡萄糖胶囊主要用于治疗关节炎和关节软骨的损伤。对于膝盖疼痛，可能是由于长期跑步导致的关节软骨受损。

根据您的描述，可能是关节软骨受损所致。建议您口服盐酸氨基葡萄糖胶囊，每次1粒，一日2次，吃饭时或饭后服用。同时，注意清淡饮食，避免辛辣、油腻食物，避免过度劳累。

在用药期间，如有任何不适，应及时就诊。另外，避免长时间站立或行走，适当休息和进行物理治疗也可以帮助缓解症状。