沙眼衣原体感染主要影响生殖系统和眼睛，引起尿道炎、宫颈炎和结膜炎等。眼疲劳和胀痛更可能与过度用眼或其他眼部问题有关。建议您去医院检查确认，排除其他可能的眼部问题。

如果您之前的治疗未完成，建议继续使用阿奇霉素片。同时，使用眼科专用滴眼液，例如左氧氟沙星滴眼液，可以缓解眼部不适。请到正规药店或医院购买，按照说明书或医嘱使用。

是的，沙眼衣原体感染可以通过性接触传播给伴侣。因此，建议您在治疗期间避免性行为，直到完全康复。