首先，感谢您提供的信息。对于12岁的孩子，确实需要关注钙的摄入。钙是构建骨骼和牙齿的重要元素，特别是在生长发育阶段。根据您提供的情况，孩子的个子偏矮，可能与钙摄入不足有关。

在日常生活中，可以通过食物来增加钙的摄入，例如虾皮、骨头汤、海鲜、豆制品等都是很好的钙源。此外，多喝水、多吃水果、多晒太阳也能帮助钙的吸收。对于补充钙片，通常不需要同时服用维生素D3，因为大多数钙片中已经含有维生素D3。

晚餐后一小时吃钙片是比较合适的。至于与牛奶一起食用，建议不要同时进行，因为牛奶中含有大量的蛋白质，可能会影响钙的吸收。白天喝牛奶是可以的，但最好与钙片的服用时间错开2小时以上。