两者在治疗膝盖疾病时的作用原理是相同的，都是通过热疗来缓解疼痛、促进血液循环和细胞再生。然而，电磁波加红外线烤灯可能会有更强的渗透力和更广泛的治疗效果。

首先，确保按照说明书正确操作。其次，使用前应清洁皮肤，避免直接照射在开放性伤口或感染部位。每次使用时间不宜过长，一般15-20分钟即可。同时，注意保持适当的距离，避免烫伤。最后，建议在医生的指导下使用，以达到最佳的治疗效果。