根据您描述的症状，宝宝可能患有消化不良。这种情况在婴幼儿中较为常见，通常与饮食和肠道菌群有关。

消化酶的最佳服用时间通常是在餐后，因为这时候消化系统正在积极工作，消化酶可以帮助分解食物，减轻消化负担。至于服用方式，可以随餐或随奶，具体看宝宝的接受情况。同时，注意使用前摇匀，避免滴头接触食物和餐具以免造成污染。