首先，肝肾囊肿是一种常见的良性病变，通常情况下不需要特殊治疗。但如果囊肿较大或引起不适，可能需要手术或其他治疗方法。四味化结汤在中医中被用作辅助治疗，但不能保证完全消除囊肿。

四味化结汤的使用时间没有严格限制，具体情况需要根据个体差异和病情变化来调整。一般来说，需要长期服用，并且配合健康的生活方式和饮食习惯。

长期使用四味化结汤可能会出现一些不良反应，如胃肠不适、成分过敏等。因此，在使用过程中，需要密切关注身体的反应，并及时向医生反馈。