维生素D3胶囊的副作用主要是长期大量服用可能导致中毒反应。

胆囊结石和肾结石患者应慎重服用维生素D3。维生素D3是脂溶性的维生素，可以促进钙质吸收，但也可能增加尿钙浓度，加重结石的症状或加速结石的形成。

建议肾结石患者定期监测尿液成分，避免高钙的饮食。最好在主治医师的指导下补充维生素D3。