毛囊炎确实可能导致长痘痘，医生开的药物可能是广谱抗生素。这种药物的副作用包括肝肾功能损害和胃肠道反应等。一般情况下，我们不建议长期服用这种药物。

如果外用药物效果不佳，口服药物可以作为辅助治疗手段。对于寻常性痤疮，每次50mg，一日2次，6周为一疗程。但是，为了安全起见，建议定期检查肝肾功能。同时，平时要注意面部清洁和补水，避免用手触碰脸上的青春痘，饮食清淡，养成良好的生活习惯，适量运动，保证规律的作息时间，多喝水、多吃新鲜的水果蔬菜。

一般情况下，需要按照医嘱完成6周的疗程。但是，在用药期间，如果出现任何不适，应及时就诊。