首先，需要确认是否确实是维生素D引起的过敏反应。通常情况下，过敏反应会在服药当天或次日出现。考虑到你女儿的症状出现在服药后3天，可能与其他因素有关。建议暂停用药，观察症状是否消失。如果症状消失，可能是药物引起的过敏反应。请注意，13岁的女孩体重35公斤，按照常规用法，早晚各一粒维生素D是安全的。

如果确定是维生素D引起的过敏反应，需要立即停止用药，并在医生的指导下进行相应的治疗。同时，建议在日常生活中注意饮食均衡，多摄入富含维生素D的食物，例如鱼类、蛋黄等。