牙痛可能是由于多种原因引起的，包括龋齿、牙周炎、牙髓炎等。考虑到你已经看过牙科医生并接受了治疗，可能是治疗过程中的正常反应。然而，如果疼痛持续或加剧，建议再次就医以排除其他潜在问题。

通常情况下，牙痛药水是安全的。但是，为了避免用药冲突，建议在使用之前与牙科医生确认。另外，使用药水时请遵循说明书上的用法用量，并注意观察是否有不良反应。

是的，如果你半夜痛醒，可以使用牙痛药水来缓解疼痛。然而，记住这只是暂时的解决方案，仍然需要找出并治疗根本原因。同时，保持良好的口腔卫生习惯也非常重要。