热淋清颗粒主要用于清热泻火、利尿通淋，适用于下焦湿热引起的尿路感染和肾盂肾炎等症状。对于肾结石，热淋清颗粒并不是首选治疗药物，建议您遵循医生的指导，使用针对肾结石的药物进行治疗。

肾结石的疼痛与大小、位置等因素有关，3毫米的肾结石可能会引起一些不适，但具体情况还需要结合您的其他症状和体检结果来判断。建议您及时就医，进行详细的检查和评估。

在使用任何药物之前，请详细阅读说明书，排除过敏及用药禁忌后遵医嘱。用药期间如有任何不适，应及时就诊。同时，保持良好的生活习惯和饮食习惯也非常重要。