环磷酰胺和复方环磷酰胺的主要区别在于组成和适应症。环磷酰胺片是单一成分的抗癌药物，适用于多种癌症。复方环磷酰胺片含有环磷酰胺和其他成分，适应症相似。

两者不良反应类似，常见的有骨髓抑制、胃肠道反应和泌尿道反应。环磷酰胺片的副作用相对较轻，建议选择环磷酰胺片，并严格按照说明书和医嘱用药。