宝宝在三个月大时出现睡觉摇头的情况，可能是由多种原因引起的，其中较为常见的有湿疹和佝偻病。

1. 湿疹：湿疹是一种常见的婴儿皮肤病，几乎80%的宝宝在出生后都会出现不同程度的湿疹症状。湿疹会导致宝宝感到瘙痒不适，尤其是在夜间，宝宝会通过摇头来缓解瘙痒感。湿疹的治疗通常包括外用药物，如硼酸溶液湿敷或弱糖皮质激素乳膏。在涂抹药物时，应尽量避免面部和腋窝等皮肤较薄的区域。

2. 佝偻病：佝偻病是一种由于维生素D缺乏引起的疾病，会导致骨骼发育异常。佝偻病的早期症状包括颅骨软化，表现为颅骨变薄，宝宝在睡觉时可能会出现摇头的情况。佝偻病的治疗主要以补充维生素D为主，同时注意宝宝的营养摄入和户外活动，以促进钙的吸收。

除了湿疹和佝偻病，宝宝睡觉摇头还可能与其他因素有关，如蚊虫叮咬、皮肤感染、过敏等。家长在发现宝宝出现睡觉摇头的情况时，应及时观察宝宝的其他症状，并带宝宝去医院进行相关检查。

在日常生活中，家长应保持宝宝的生活环境清洁，避免蚊虫叮咬。同时，注意宝宝的饮食营养，保证足够的维生素D摄入，适当进行户外活动，以促进宝宝的健康成长。

此外，家长还应关注宝宝的心理健康，与宝宝建立良好的亲子关系，及时了解宝宝的需求和情绪变化，为宝宝提供一个温馨、舒适的生活环境。