怀孕初期，流产是一种较为常见的现象。当孕妇发现自己怀孕40天时出现自然流产的情况，应及时就医，进行全面的检查。

首先，医生会根据患者的症状，如阴道出血情况，判断是否需要进一步检查。如果出血较多，医生会建议进行B超检查，以判断胚胎是否完全排出，以及宫腔内是否存在积血。

如果B超检查结果显示胚胎没有完全排出，或者宫腔内有积血，医生会建议进行清宫手术，同时配合口服益母草等药物，加强宫缩，促进子宫内残留物排出，减少出血。

需要注意的是，早孕期自然流产的概率较高，大约为30%左右。这并不意味着胚胎不健康，很多健壮的胚胎会顺利发育成健康的胎儿。因此，孕妇不必过于担忧。

在治疗期间，孕妇需要卧床休息，避免过度劳累和精神紧张。同时，要保持会阴部清洁，预防感染。此外，孕妇还需要注意日常饮食，多吃富含营养的食物，如新鲜蔬菜、水果、肉类等，以增强体质。

在治疗结束后，孕妇需要定期复查，监测子宫恢复情况。如果再次怀孕，建议在半年后进行，并在怀孕前进行全面检查，包括甲状腺功能、激素水平、孕酮水平等，以确保胚胎的健康发育。

此外，男方也需要进行相关检查，如精液检查等，以确保精子质量，提高受孕率。

导致怀孕40天自然流产的原因有很多，主要包括以下几方面：

• 胚胎因素：染色体异常、基因突变等。
• 母亲因素：内分泌失调、免疫系统异常、感染、创伤等。
• 环境因素：有害化学物质、辐射等。
• 精神心理因素：过度紧张、焦虑等。
• 不良生活习惯：吸烟、饮酒等。

总之，怀孕40天自然流产是孕早期常见的一种现象。孕妇不必过于担忧，应及时就医，接受专业治疗，同时保持良好的心态，积极面对生活。