脑膜炎球菌血症是一种严重的细菌感染，及时诊断和鉴别诊断至关重要。以下是一些常见的鉴别诊断方法：

1. 化脓性脑膜炎：与化脓性脑膜炎的鉴别主要依靠脑脊液检查。化脓性脑膜炎的脑脊液细胞数通常较高，且以中性粒细胞为主。此外，患者可能有结核接触史、结素反应阳性及肺部X线检查异常等表现。

2. 病毒性中枢神经系统感染：病毒性脑炎、病毒性脑膜炎和病毒性脊髓炎等病毒感染也可能与脑膜炎球菌血症混淆。病毒性脑膜炎的脑脊液生化检查通常显示糖及氯化物正常或稍高，蛋白含量不高。此外，病毒分离和血清学检查等实验室检查有助于确诊。

3. 新型隐球菌脑膜脑炎：新型隐球菌脑膜脑炎的病程较长，症状较轻。患者可能有慢性进行性颅压高症状。确诊主要依靠脑脊液涂片检查，可见新型隐球菌的厚荚膜孢子。

4. 脑脓肿：脑脓肿患者可能有中耳炎、头部外伤或先天性心脏病等病史。脑脓肿的脑脊液检查通常显示细胞数正常或稍高，以淋巴细胞为主。影像学检查如CT、MRI等有助于确诊。

5. 脑肿瘤：脑肿瘤与脑膜炎球菌血症的鉴别主要依靠临床表现和影像学检查。脑肿瘤患者可能表现为头痛、恶心、呕吐、视力障碍等。脑脊液检查可能正常。CT、MRI等影像学检查有助于确诊。

6. 不典型结脑：部分结脑病例可能表现为不典型症状，如婴幼儿起病急、进展快、早期出现脑实质损害症状等。诊断时需结合病史、临床表现和辅助检查进行综合判断。