新生儿巨细胞病毒感染是一种常见的病毒性疾病，对新生儿的健康和发育造成严重影响。为了准确诊断和鉴别巨细胞病毒感染，以下几种方法可供参考：

1. 与先天性梅毒的鉴别：先天性梅毒的症状与巨细胞病毒感染相似，如肝脾肿大、皮肤瘀斑、脉络膜视网膜炎等。鉴别要点在于了解母亲的感染情况，并通过化验婴儿血清进行区别。

2. 与婴儿肝炎的鉴别：婴儿肝炎的肝脏病理改变可见肝细胞水肿和类似慢性肝炎样改变，也可引起重型肝炎改变。鉴别要点在于观察婴儿的临床表现，如黄疸、肝功能异常等，并结合实验室检查结果。

3. 与先天性风疹的鉴别：先天性风疹的症状与巨细胞病毒感染有相似之处，如皮肤斑点、肝脾肿大、溶血性贫血等。鉴别要点在于观察婴儿的临床表现，如先天性心脏、中心性白内障等，并通过母亲感染情况和病儿血清中的抗体进行区别。

4. 与先天性弓形体感染的鉴别：先天性弓形体感染与妊娠关系密切，母亲在妊娠期受到弓形体感染后，可导致胎儿畸形、早产、死产等严重后果。鉴别要点在于了解母亲的感染情况，并通过实验室检查进行区别。

5. 与其他疾病的鉴别：新生儿巨细胞病毒感染还需与其他病因的病理性黄疸、其他感染性脑病、脑膜脑炎等进行鉴别，主要依赖实验室检查结果。

总之，新生儿巨细胞病毒感染的诊断鉴别需要综合考虑婴儿的临床表现、实验室检查结果、母亲的感染情况等多方面因素，以便为新生儿提供及时、有效的治疗。