男性生殖系结核是一种常见的疾病，诊断和鉴别诊断对于治疗方案的选择至关重要。以下是一些常见的鉴别诊断方法：

1. 前列腺结石：患者可能会出现尿频、排尿困难、腰骶部或会阴部疼痛等症状，前列腺指诊可扪及结石或结石摩擦感。通过X线平片和B超检查可以确诊。

2. 前列腺癌：晚期患者可能会出现排尿困难、尿路刺激症状等，前列腺指诊时可触及硬结。通过PSA检查、CT及前列腺穿刺活检可以进行鉴别。

3. 慢性前列腺炎：患者可能会出现下腹、腰骶部或会阴区疼痛及坠胀不适感，前列腺指诊前列腺外形正常或肿大，质地多正常或稍硬。通过尿常规和前列腺液检查可以进行鉴别。

4. 非特异性肉芽肿性前列腺炎：患者可能会出现尿道刺激症状、会阴部、腰骶部疼痛不适及射精痛等症状，前列腺肿大有硬结。通过血常规和前列腺液检查可以进行鉴别。

5. 非特异性附睾炎：患者可能会出现阴囊皮肤充血发红、鞘膜积液、疼痛及压痛等症状。通过血常规和尿液检查可以进行鉴别。

6. 丝虫病：患者有丝虫病流行区居住史及丝虫感染史。通过血常规和尿液检查可以进行鉴别。

7. 精液囊肿：患者有附睾结节，多位于近附睾头部，为囊性感。通过诊断性穿刺可以确诊。

8. 附睾良性肿瘤：患者有附睾肿块，多为圆形肿块，稍硬。通过影像学检查可以确诊。

9. 附睾淤积：患者有输精管结扎史，附睾尾部肿大。通过影像学检查可以确诊。

10. 淋菌性附睾炎：患者有淋病史，呈急性过程，局部红肿疼痛。通过尿道分泌物检查可以确诊。

11. 附睾精子肉芽肿：患者有附睾肿块，表面光滑，中等硬度。通过影像学检查可以确诊。

12. 非特异性附睾睾丸炎：患者有阴囊坠痛不适，常有后尿道炎、前列腺炎及精囊炎病史。通过尿液检查和影像学检查可以确诊。

13. 睾丸肿瘤：患者有睾丸肿块，生长迅速，质硬。通过影像学检查可以确诊。

14. 淋菌性附睾睾丸炎：患者有阴囊肿胀疼痛，急性发病1～2天后，睾丸附睾明显增大。通过尿道分泌物检查可以确诊。