十二指肠重复畸形是一种较为罕见的先天性消化道畸形，其发病原因尚不完全明确。目前，医学界普遍认为，其发病原因可能与以下几种学说有关：

1. 空化不全学说：该学说认为，在胚胎早期，由于消化道发育过程中细胞增殖，导致消化道变成实心期，随后实心期肠腔内形成纵形排列的空泡，互相融合形成管腔。若在此过程中，空泡未能完全融合，则可能形成狭窄、闭锁等畸形，甚至形成重复畸形。

2. 憩室形外袋未退化学说：该学说认为，在胚胎早期，消化道的各部分存在憩室形外袋，如回肠最多。在正常情况下，这些憩室形外袋会逐渐自行退化。若退化不全，则可能形成重复畸形。

3. 胚胎孪生学说：该学说认为，十二指肠重复畸形可能与胚胎孪生畸形有关，如双阴茎阴囊、双子宫阴道、双尿道等。

4. 脊索与原肠分离障碍学说：该学说认为，在胚胎第3周脊索形成时，内外胚层发生粘连，分离困难，导致肠管与神经管分离障碍，从而在肠管形成时发生憩室样突起，进而形成各种形态的消化道重复畸形。

除了上述学说，还有一些其他因素可能参与十二指肠重复畸形的发病过程，如遗传因素、感染等。

了解十二指肠重复畸形的发病原因，有助于我们更好地预防和治疗这种疾病。