新冠病毒又变异了！核酸检测会不会失效？

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我是大医生

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自2020年新冠肺炎爆发以来，新冠病毒不断变异，一次又一次地进攻我们的免疫防线，引发较大范围的流行。2021年11月9日，我们又在南非检测到一种新的冠状病毒。11月26日，WHO将其定义为第五种需要密切关注的毒株，取名为奥密克戎（希腊字母Omicron）。^[1]面对如此多变的新冠病毒，我国的核酸检测试剂还能不能“hold住”呢？就让我们一起来看一下。

一. 什么是核酸检测？

在丰饶而神秘的自然界，盛放着百万计的生命；而生命之所以如此多姿多彩，与遗传物质的多样性密切相关。和人类不同，新冠病毒的遗传物质是单链RNA。RNA的全称是核糖核酸，它由四种基本单位——核糖核苷酸串联而成，这四种核苷酸能以不同的顺序组合，构成多种多样的RNA，进而造就种类繁多的RNA病毒。

新冠病毒拥有自己独特的RNA。我们说它独特，并不是说它和其他的RNA完全不同，而是说它有着一些别的病毒所没有的特殊部分或序列。我们可以通过一种叫做逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)的技术，把这一特异性的RNA序列进行扩增，然后用荧光标记，再用探测器检验荧光信号，用以确定病毒RNA的存在。这一过程就叫做核酸检测，这一特殊的RNA序列则是核酸检测的对象或者靶标。

二. 奥密克戎的突变位点

遗传物质DNA或者RNA上，真正具有遗传效应，也就是能指导蛋白质合成，进而控制生物性状的序列叫做基因。在新冠病毒RNA上，有5个必需基因，分别指导合成病毒的核(N)蛋白、包膜(E)蛋白、基质(M)蛋白、刺突(S)蛋白和RNA聚合酶(RdRp)^[2]。这些蛋白都是病毒的基本组成部分，和病毒的致病性、传播力和免疫逃逸能力密切相关；一旦发生突变，受到“强化”的病毒就可能引发新的流行。

对奥密克戎的基因组进行分析，发现其突变位点主要集中在S蛋白基因的高变异区。病毒可能因此获得更强的细胞受体亲和力和复制能力，其具体的性状的改变还有待进一步的研究。^[1]

三. 核酸检测的两大靶标

1. ORF1ab区

中国疾控中心病毒所公布的核酸检测靶标主要有2个——一个是ORF1ab区的RdRp基因，另一个是N蛋白基因^[1]。什么是ORF1ab区呢？原来，在病毒的基因组中，除了有上述5种必需基因外，还有多个非结构基因，指导合成各种酶类，参与病毒的生物合成过程。ORF1ab区就包含很多这样的基因，其中的RdRp基因具有较高的特异性，更是我们的检测靶标。^[3]

2. N基因

N基因指导病毒核蛋白的合成，具有一定的特异性，也是我们的检测靶标。核蛋白能和病毒RNA结合在一起，起着稳定病毒RNA的功能，是一种非常重要的病毒蛋白。