泮托拉唑钠肠溶胶囊作为一种常用的治疗消化性溃疡和反流性食管炎的药物，在临床应用中受到了广泛认可。然而，任何药物都存在一定的副作用，了解这些副作用对于患者来说至关重要。

在胃肠道系统方面，泮托拉唑钠肠溶胶囊可能会引起一些胃肠道症状，如上腹痛、腹泻、便秘或腹胀。极少数患者可能会出现恶心。对于神经系统，偶尔会引起头痛，个别人可能会出现头晕或视力障碍。在肾和泌尿系统方面，罕见间质性肾炎的发生。

皮肤及皮下组织方面，泮托拉唑钠肠溶胶囊可能会引起过敏性反应，如瘙痒、皮疹，个别人可能会出现荨麻疹、血管神经性水肿。罕见严重的皮肤反应，如Stevens Johnson综合症、多形性红斑、光过敏和Lyell综合症。在肝胆系统方面，个别人可能会出现肝转氨酶升高，极个别病例可能出现严重肝细胞损害，伴或不伴有肝衰竭。

肌肉骨骼系统方面，个别人可能会出现肌痛，但通常在治疗结束时消失。在精神方面，个别人可能会出现抑郁，但同样在治疗结束时消失。代谢系统方面，个别人可能会出现甘油三酯水平增高。免疫系统方面，极个别病例可能出现过敏反应，如过敏性休克。

泮托拉唑钠肠溶胶囊的禁忌症包括哺乳期妇女及妊娠三个月内妇女禁用，对本品过敏者禁用。在使用泮托拉唑钠肠溶胶囊之前，应排除胃与食道的恶性病变，以免因症状缓解而延误诊断。肝肾功能不全者应慎用，严重肝病时本品清除延缓，应减少用量。此外，泮托拉唑钠肠溶胶囊不宜与其他抗酸剂和抑酸剂合用，不宜大剂量长期使用。

泮托拉唑钠肠溶胶囊应在遮光、密封、阴凉处保存。如果患者在使用过程中出现任何不适，应及时咨询医生。