巴曲酶注射液是一种含有类凝血酶的药物，主要用于治疗急性脑梗死、改善闭塞性血管病引起的缺血性症状，以及改善末梢及微循环障碍。然而，使用该药物时需要注意其可能带来的副作用和禁忌症。

首先，巴曲酶注射液可能会引起一些肝脏和肾脏的副作用。在肝脏方面，可能会出现谷草转氨酶（GOT）、谷丙转氨酶（GPT）升高，有时还会伴随碱性磷酸酶升高。在肾脏方面，可能会出现尿素氮（BUN）升高、血清肌酐升高，以及蛋白尿等症状。

此外，消化系统也可能受到巴曲酶注射液的影响，表现为恶心、呕吐、胃痛、食欲不振、胃部不快感等。血液系统也可能受到影响，出现嗜酸性粒细胞增高、白细胞增高或减少、红细胞减少、血红蛋白减少等。

巴曲酶注射液还可能引起精神神经系统的副作用，如头晕、脚步蹒跚、头痛、头重、麻木感等。感觉器官也可能受到影响，如耳鸣、眼痛、视觉模糊感、眼振等。代谢异常也可能出现，如中性脂肪升高、总胆固醇升高等。

过敏反应也是巴曲酶注射液可能引起的副作用之一，如皮疹、荨麻疹等。注射部位也可能出现皮下出血、止血延迟、血管痛等症状。此外，还可能出现胸痛、发热、冷感、不快感、无力感、心外膜炎、鼻塞等。

需要注意的是，巴曲酶注射液有一些禁忌症。例如，有出血倾向的患者（如出凝血障碍性疾病、血管障碍所致出血倾向、活动性消化道溃疡、疑有颅内出血者等）、新近手术患者、正在使用抗凝药物的患者、血纤维蛋白原浓度低于100mg/dl的患者、重度肝或肾功能障碍的患者等均应禁用或慎用。

在使用巴曲酶注射液时，患者应密切注意自身的症状，一旦出现异常应立即停药并寻求医生的帮助。孕妇、哺乳期妇女、儿童和老年人在使用该药物时也应注意相关注意事项。