新生儿直肠阴道瘘需要根据瘘口大小和手术情况来决定是否需要手术。对于两厘米以内的低位直肠阴道瘘，宝宝可以通过瘘口排出大便。然而，随着宝宝的成长，如果瘘口不能满足排便需求，可能需要进行手术治疗。由于孩子小抵抗力弱，手术时机需要谨慎选择。建议定期观察宝宝的排便情况，避免感染和其他并发症的发生。