患者咽喉不适五个月，疼痛时轻时重，深吸气时喉咙痛，伴有咳嗽。医生建议做颈部CT检查以排除咽旁间隙问题。患者男性40岁

根据症状和医生建议，患者可能患有咽旁间隙疾病。建议尽快就医进行颈部CT检查以明确诊断。治疗需根据具体病情制定方案。注意及时就医，不要自行用药。