在进行生殖器疱疹的诊断过程中，医生会详细询问患者的病情状况以及症状、病史，并结合自身的临床经验以及典型临床表现进行诊断。这一过程不仅需要关注患者的血液常规检查，还需要结合单纯疱疹病毒(HSV)分离培养与鉴定、HSV抗原抗体检测、PCR方法检测HSV-DNA等实验室检查结果，从而进行综合性判断。

然而，诊断生殖器疱疹并非易事，因为需要与多种疾病进行鉴别。以下是其中一些需要鉴别的疾病：

1. 硬下疳：硬下疳是一期梅毒疹，潜伏期3-4周，呈单发性硬结或溃疡，溃疡比生殖器疱疹深，基底呈软骨样硬度，无自觉疼痛及触痛。

2. 软下疳：在性接触后3天左右于外生殖器容易发生单发或多发性浅表溃疡，基底柔软，边缘不整，呈穿凿状，自觉疼痛，触痛明显。

3. 白塞氏综合征：又名眼、口、生殖器综合征，这种疾病可能为自身免疫性疾病，与性生活接触没有任何关系。

4. 急性女阴溃疡：发生于女阴的急性疼痛性溃疡，多见于10-30岁的女性，且多数为未婚处女，与性接触无关。

5. 固定性药疹：与性接触无关，起病前有明确的服药史。红斑好发于皮肤黏膜交界处，严重时出现水疱、大疱及溃疡。

6. 性病性淋巴肉芽肿：又称为第四性病，由沙眼衣原体引起，潜伏期5-12日，病程分三期。

7. 外阴带状疱疹：带状疱疹是由水痘-带状疱疹病毒引起，水疱较大较多，疼痛明显，疱疹分布在一侧，治愈后不复发。

8. 外阴部固定红斑性药疹：发病与服药过敏有关，特别是服用磺胺类药物后，局部出现红斑、水疱、大疱、糜烂、溃疡，自觉痒痛难忍，通过抗过敏治疗有明显疗效。

因此，医生需要仔细将以上所述的疾病与生殖器疱疹进行鉴别，以提高确诊的科学性和正确性，为今后治疗提供一个参考和鉴定。