近年来,肠出血性大肠杆菌(EHEC)引起的疫情频发,给人们的健康带来了严重威胁。近日,德国明斯特大学和美国生命技术公司的研究人员公布了EHEC的基因组草图,为疫情监控和治疗提供了重要参考。
据悉,该基因组草图是通过新一代测序技术完成的。研究人员对比了此次疫情中O104:H4型肠出血性大肠杆菌与2001年采集的O104:H4型肠出血性大肠杆菌的基因序列,发现两者并非同源。此次疫情中O104:H4菌株来自肠聚集性大肠杆菌EAEC O104:H4 55989菌株的变异,并掺杂了一种目前未知的由志贺毒素产生的O104:H4菌株。
这项研究再次强调了积累的重要作用。从1996年起,研究人员就开始了溶血性尿毒症症候群等疾病的研究和生物样本的采集工作,为发现高致病性EHEC菌株的变异提供了重要基础。
明斯特大学微生物学家达格·哈马舍尔教授表示,多亏有了离子流个人化操作基因组测序仪(PGM)和新一代测序技术(NGS)的帮助,测序工作才能进行得如此迅速。这种快速测序技术为突发疫情的实时研究提供了有力支持。
明斯特大学医学院院长威廉·施密茨认为,这项研究不仅有助于对疫情的监测和诊断,还可能催生新疗法的产生。
总之,EHEC基因组草图的公布为我国EHEC疫情的研究和防控提供了有力支持,有助于我国科研人员更好地应对EHEC疫情。
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